火影前期的強者，一個人毀了木葉村，其一生卻很悲慘

長門是漩渦一族的後裔（血統遺傳自母親），“曉”的首領，繼半藏之後雨隱之村的新一任首領。擁有宇智波斑所給予的輪回眼，是佩恩六道的操控者。原為第二次忍界大戰雨隱村的戰爭孤兒，在識別了小南和彌彥後跟隨自來也學習忍術。一生經歷了父母雙亡及彌彥之死兩大痛楚後，被“宇智波斑（宇智波帶土）”蠱惑，決定在痛苦的輪回中孕育和平。

在摧毀木葉事件中，被漩渦鳴人感化，重拾少年時期的夢想，犧牲自己使用“外道·輪回天生之術”復活了佩恩襲擊木葉一戰中死去的人，在將自己的意志托付給鳴人後力竭而亡。第四次忍界大戰中被藥師兜使用“穢土轉生之術”召喚當做工具，之後被宇智波鼬、漩渦鳴人和奇拉比聯手封印。

輪回眼

宇智波斑為了實行月之眼計劃，將輪回眼移植於千手一族的遠親漩渦一族的後裔——幼年的長門身上，期望日後長門能用外道·輪回天生之術復活自己，而長門從此擁有了輪回眼。

哭泣的國家

第二次忍界大戰時期，兩名木葉忍者闖入長門家裡。誤以為長門的父母為敵方的忍者遂將其父母殺死。受驚的長門無意識地使用輪回眼，將入侵者擊斃。失去了雙親的長門從此過著流浪的日子…後來暈倒在路上被經過的小南救起，並把長門帶到了一個基地裡結識了彌彥，同為戰爭孤兒的三人決定相依為命。

一天三人走在路上險些被天上落下綁有引爆符的苦無擊中，隨後三人發現在不遠處雨隱之村的首領半藏正與三位木葉忍者（後來的木葉三忍）交戰。當時淪為三大國主戰場的雨隱之村戰亂不斷。回去之後，長門和彌彥、小南為了得到力量使自己變強，能改變這個長期戰亂不斷的國家，決定跟之前和半藏交戰的三位木葉忍者學習忍術。於是三人一起開始踏上了尋找木葉三忍的旅途……歷經艱險，三人終於邂逅了木葉三忍。後來自來也決定留下照顧戰後孤兒，權當作對這個飽受戰火的國家的補償。

第二次忍界大戰結束後，雨隱之村還處於動亂時期，依舊有殘留流亡忍者為了搶奪食物財產甚至為了報復去騷擾雨忍村民，這段時間長門三人在自來也的教導下學習忍術。

三年後，自來也看到三個孩子可以獨立了，把和平的重任托付給了長門就離開了他們。

摯友殞命

長大後的三人以彌彥為首創立了曉。立志不靠極端武力來創造世界和平，之後有許多人加入了這個組織，曉逐漸壯大並聲名鵲起。遠在木葉的自來也還偶爾聽到他們在幾次戰斗的事跡。中途宇智波帶土（此時身份為宇智波斑）曾經找過長門，並試圖拉攏長門等人，但被長門彌彥拒絕。

當時的雨隱之村的首領半藏受到志村團藏的蠱惑，害怕他們勢力的擴大會威脅到自己的統治地位，所以半藏欺騙他們說，想借用他們的力量，向火、風、土三大國提出和平的交涉提案（因為雨隱之村處在三大國的交接處，戰略地位非常重要，而且當時第三次忍界大戰愈演愈烈），彌彥答應了他的請求。但是他們到了會談的地點，才發現這是個圈套，半藏勾結團藏，在會談地點埋伏，參與抹殺他們三個的還有木葉的暗部。半藏以事先擒獲的小南的性命作要挾讓長門殺了彌彥，彌彥為了救小南讓長門殺了自己。在不知如何抉擇之時，彌彥撞到了長門的苦無上，倒在了長門身旁。就當半藏要將他們全部殲滅的時候，長門擋住了半藏的手下的所有攻擊，然後救下小南，雙腿中了半藏的火遁·起爆炎陣。眼見遭受欺騙，摯友又死於眼前，在極度憤怒之下使用輪回眼召喚出外道魔像，震驚了全場所有人。之後木葉的暗部和半藏的手下都被外道魔像抽取靈魂，半藏、團藏落荒而逃。

彌彥死後，長門成為了曉的首領，並使用輪回眼制出了屍體傀儡佩恩六道，彌彥的遺體被長門制作成為佩恩六道之中的天道佩因，用來統率曉組織。

後來，半藏被長門操縱下的佩恩六道所殺，從此長門支配了雨隱之村。

對戰自來也

自來也為打探曉首領的情報，潛入了雨隱之村。之後見到了佩恩及小南，這才知道原來曉首領佩恩是自己第二次忍界大戰末期在雨隱之村所收的徒弟——長門。冷酷無情的佩恩已不再顧念師徒之情，故一場師徒之戰一觸即發。自來也使出仙人模式，並召來兩位蛤蟆仙人（深作及志間仙人）相助，成功打敗了佩恩三道。但因之後不了解佩恩六道的相關情報，所以最終被佩恩六道打敗而亡。但最後自來也查出了佩恩六道及其本體的秘密（都是自己曾經遇到的忍者，佩恩六道均為屍體傀儡，受長門操控）。

摧毀木葉

佩恩和小南一起襲擊木葉捕捉九尾人柱力——漩渦鳴人。修羅道、畜生道、餓鬼道分為誘敵組；天道、人間道、地獄道和小南為探索組，開始了襲擊。期間與卡卡西交戰，並殺死了卡卡西，在用人間道得知了鳴人在妙木山後，控制天道騰飛到木葉上空，然後用畜生道將修羅道、人間道、餓鬼道、地獄道還有小南通靈到木葉村外，不惜以縮短壽命的代價，執意使用了神羅天征將整個木葉隱村摧毀！之後佩恩六道與從妙木山趕回來的漩渦鳴人交戰。

佩恩六道被漩渦鳴人逐個擊敗後，鳴人在小南用紙制作的一棵大樹裡找到了佩恩的本體——長門，兩位預言之子終於相遇。鳴人想要知道長門的過去，並想從長門的經歷找出和平的答案。長門將父母之死及摯友彌彥之死一生兩大痛楚向鳴人講述後，鳴人拿出了自來也的寫的第一本書《毅力忍傳》。《毅力忍傳》的寫作靈感來源於自來也的一個弟子，這個弟子正是長門。一番談話後，長門被鳴人所感化，重拾年少時期的夢想，放棄和宇智波帶土的原定計劃，用外道·輪回天生之術復活了在木葉一戰所死之人，將自己的意志托付給了鳴人，期待鳴人能夠完成《鳴人物語》，力竭而亡。